Kodon

Kodon je niz triju nukleotida koji se nalazi na molekuli glasničke RNK. Određuje položaj određene aminokiseline u procesu sinteze bjelančevina^[1] u stanici, čime djeluju kao jedinica genetičkoga kodiranja. Ovi su nukleotidi uzastopni.^[2] Svaka trojka nukleotida prepisana s DNK na glasničku RNK naziva se kodon ili kod^[3] i predstavlja osnovnu jedinicu genskog koda.^[4]

Kodone u procesima sinteze bjelančevina dijelimo na:^[2]

početni kodon: AUG – kodira aminokiselinu metionin, koja označava početak stvaranja polipeptidnoga lanca
završni kodon (STOP-kodon), koji označava kraj stvaranja polipeptidnoga lanca, ali ne kodira ni jednu aminokiselinu jer mu ne postoji ni jedan komplementarni antikodon. Postoje 3 poznata STOP-kodona: UAG, UAA i UGA (za RNK), te TAG, TAA i TAG (za DNK).

Tablica translacije

Podrobniji članak o temi: Translacija (biologija)

Biokemijska svojstva aminokiselina	Nepolarna	Polarna	Bazična	Kisela ↓		Kraj: stop kodon

Standardna tablica RNA kodona

Standardni genetski kod^[5]^[6]
Prvi nukleotid	Drugi nukleotid								Treći nukleotid
Prvi nukleotid	U		C		A		G		Treći nukleotid
U	UUU	(Phe/F) Fenilalanin	UCU	(Ser/S) Serin	UAU	(Tyr/Y) Tirozin	UGU	(Cys/C) Cistein	U
	UUC	(Phe/F) Fenilalanin	UCC		UAC	(Tyr/Y) Tirozin	UGC	(Cys/C) Cistein	C
	UUA	(Leu/L) Leucin	UCA		UAA	Stop	UGA	Stop	A
	UUG		UCG		UAG	Stop	UGG	(Trp/W) Triptofan	G
C	CUU		CCU	(Pro/P) Prolin	CAU	(His/H) Histidin	CGU	(Arg/R) Arginin	U
	CUC		CCC		CAC	(His/H) Histidin	CGC		C
	CUA		CCA		CAA	(Gln/Q) Glutamin	CGA		A
	CUG		CCG		CAG	(Gln/Q) Glutamin	CGG		G
A	AUU	(Ile/I) Izoleucin	ACU	(Thr/T) Treonin	AAU	(Asn/N) Asparagin	AGU	(Ser/S) Serin	U
	AUC		ACC		AAC	(Asn/N) Asparagin	AGC	(Ser/S) Serin	C
	AUA		ACA		AAA	(Lys/K) Lizin	AGA	(Arg/R) Arginin	A
	AUG	(Met/M) Metionin	ACG		AAG	(Lys/K) Lizin	AGG	(Arg/R) Arginin	G
G	GUU	(Val/V) Valin	GCU	(Ala/A) Alanin	GAU	(Asp/D) Asparaginska kiselina ↓	GGU	(Gly/G) Glicin	U
	GUC		GCC		GAC	(Asp/D) Asparaginska kiselina ↓	GGC		C
	GUA		GCA		GAA	(Glu/E) Glutaminska kiselina ↓	GGA		A
	GUG		GCG		GAG	(Glu/E) Glutaminska kiselina ↓	GGG		G

Inverzna tablica RNA kodona

Inverzna tablica za standardni genetski kod^[7]
Aminokiselina	DNA kodoni	Skraćeno	Aminokiselina	DNA kodoni	Skraćeno
Ala, A	GCU, GCC, GCA, GCG	GCN	Ile, I	AUU, AUC, AUA	AUH
Arg, R	CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG	CGN, AGR; ili CGY, MGR	Leu, L	CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG	CUN, UUR; ili CUY, YUR
Asn, N	AAU, AAC	AAY	Lys, K	AAA, AAG	AAR
Asp, D	GAU, GAC	GAY	Met, M	AUG
Asn ili Asp, B	AAU, AAC; GAU, GAC	RAY	Phe, F	UUU, UUC	UUY
Cys, C	UGU, UGC	UGY	Pro, P	CCU, CCC, CCA, CCG	CCN
Gln, Q	CAA, CAG	CAR	Ser, S	UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC	UCN, AGY
Glu, E	GAA, GAG	GAR	Thr, T	ACU, ACC, ACA, ACG	ACN
Gln ili Glu, Z	CAA, CAG; GAA, GAG	SAR	Trp, W	UGG
Gly, G	GGU, GGC, GGA, GGG	GGN	Tyr, Y	UAU, UAC	UAY
His, H	CAU, CAC	CAY	Val, V	GUU, GUC, GUA, GUG	GUN
START	AUG		STOP	UAA, UGA, UAG	URA, UAR

Standardna tablica DNA kodona

Standardni genetski kod^{[note 1]}^[8]
Prvi nukleotid	Drugi nukleotid								Treći nukleotid
Prvi nukleotid	T		C		A		G		Treći nukleotid
T	TTT	(Phe/F) Fenilalanin	TCT	(Ser/S) Serin	TAT	(Tyr/Y) Tirozin	TGT	(Cys/C) Cistein	T
	TTC	(Phe/F) Fenilalanin	TCC		TAC	(Tyr/Y) Tirozin	TGC	(Cys/C) Cistein	C
	TTA	(Leu/L) Leucin	TCA		TAA	Stop	TGA	Stop	A
	TTG		TCG		TAG	Stop	TGG	(Trp/W) Triptofan	G
C	CTT		CCT	(Pro/P) Prolin	CAT	(His/H) Histidin	CGT	(Arg/R) Arginin	T
	CTC		CCC		CAC	(His/H) Histidin	CGC		C
	CTA		CCA		CAA	(Gln/Q) Glutamin	CGA		A
	CTG		CCG		CAG	(Gln/Q) Glutamin	CGG		G
A	ATT	(Ile/I) Izoleucin	ACT	(Thr/T) Treonin	AAT	(Asn/N) Asparagin	AGT	(Ser/S) Serin	T
	ATC		ACC		AAC	(Asn/N) Asparagin	AGC	(Ser/S) Serin	C
	ATA		ACA		AAA	(Lys/K) Lizin	AGA	(Arg/R) Arginin	A
	ATG	(Met/M) Metionin	ACG		AAG	(Lys/K) Lizin	AGG	(Arg/R) Arginin	G
G	GTT	(Val/V) Valin	GCT	(Ala/A) Alanin	GAT	(Asp/D) Asparaginska kiselina ↓	GGT	(Gly/G) Glicin	T
	GTC		GCC		GAC	(Asp/D) Asparaginska kiselina ↓	GGC		C
	GTA		GCA		GAA	(Glu/E) Glutaminska kiselina ↓	GGA		A
	GTG		GCG		GAG	(Glu/E) Glutaminska kiselina ↓	GGG		G

Inverzna tablica DNA kodona

Inverzna tablica za standardni genetski kod^[7]
Aminokiselina	DNA kodoni	Skraćeno	Aminokiselina	DNA kodoni	Skraćeno
Ala, A	GCT, GCC, GCA, GCG	GCN	Ile, I	ATT, ATC, ATA	ATH
Arg, R	CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG	CGN, AGR; ili CGY, MGR	Leu, L	CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG	CTN, TTR; ili CTY, YTR
Asn, N	AAT, AAC	AAY	Lys, K	AAA, AAG	AAR
Asp, D	GAT, GAC	GAY	Met, M	ATG
Asn ili Asp, B	AAT, AAC; GAT, GAC	RAY	Phe, F	TTT, TTC	TTY
Cys, C	TGT, TGC	TGY	Pro, P	CCT, CCC, CCA, CCG	CCN
Gln, Q	CAA, CAG	CAR	Ser, S	TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC	TCN, AGY
Glu, E	GAA, GAG	GAR	Thr, T	ACT, ACC, ACA, ACG	ACN
Gln ili Glu, Z	CAA, CAG; GAA, GAG	SAR	Trp, W	TGG
Gly, G	GGT, GGC, GGA, GGG	GGN	Tyr, Y	TAT, TAC	TAY
His, H	CAT, CAC	CAY	Val, V	GTT, GTC, GTA, GTG	GTN
START	ATG		STOP	TAA, TGA, TAG	TRA, TAR

Vidi

Genska uputa (genski kod)
Genska karta

Bilješke

↑ Glavna razlika između DNA i RNA je da je DNA baza timin (T) unutar RNA zamjenjena uracilom (U). To je jedina razlika u tablicama DNA i RNA kodona

Izvori

↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 68
↑ ^2,0 ^2,1 "kodon". Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. http://www.enciklopedija.hr/Natuknica.aspx?ID=32214 Pristupljeno 26. veljače 2015.
↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 46-47
↑ "genski kôd". Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. http://www.enciklopedija.hr/natuknica.aspx?ID=21607 Pristupljeno 26. veljače 2015.
↑ "Amino Acid Translation Table". Oregon State University. Inačica izvorne stranice arhivirana 29. svibanj 2020.. http://sites.science.oregonstate.edu/genbio/otherresources/aminoacidtranslation.htm Pristupljeno 2. prosinac 2020.
↑ "The Information in DNA Determines Cellular Function via Translation". Nature. Inačica izvorne stranice arhivirana 23. rujan 2017.. https://www.nature.com/scitable/topicpage/the-information-in-dna-determines-cellular-function-6523228/ Pristupljeno 5. prosinac 2020.
↑ ^7,0 ^7,1 IUPAC—IUB Commission on Biochemical Nomenclature. "Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and Their Constituents". International Union of Pure and Applied Chemistry. http://publications.iupac.org/pac/1974/pdf/4003x0277.pdf Pristupljeno 5. prosinac 2020.
↑ "Genes". Boston University. Inačica izvorne stranice arhivirana 28. travanj 2020.. https://sphweb.bumc.bu.edu/otlt/MPH-Modules/PH/DNA-Genetics/DNA-Genetics3.html Pristupljeno 10. prosinac 2020.

[8] Glavna razlika između DNA i RNA je da je DNA baza timin (T) unutar RNA zamjenjena uracilom (U). To je jedina razlika u tablicama DNA i RNA kodona

[hinus-1] Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 68

[HE-kodon-2] 2,0 ^2,1 "kodon". Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. http://www.enciklopedija.hr/Natuknica.aspx?ID=32214 Pristupljeno 26. veljače 2015.

[hinus-genetička_uputa-3] Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 46-47

[HE-genski_kod-4] "genski kôd". Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. http://www.enciklopedija.hr/natuknica.aspx?ID=21607 Pristupljeno 26. veljače 2015.

[RNA_kodon_table-5] "Amino Acid Translation Table". Oregon State University. Inačica izvorne stranice arhivirana 29. svibanj 2020.. http://sites.science.oregonstate.edu/genbio/otherresources/aminoacidtranslation.htm Pristupljeno 2. prosinac 2020.

[6] "The Information in DNA Determines Cellular Function via Translation". Nature. Inačica izvorne stranice arhivirana 23. rujan 2017.. https://www.nature.com/scitable/topicpage/the-information-in-dna-determines-cellular-function-6523228/ Pristupljeno 5. prosinac 2020.

[iupac-7] 7,0 ^7,1 IUPAC—IUB Commission on Biochemical Nomenclature. "Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and Their Constituents". International Union of Pure and Applied Chemistry. http://publications.iupac.org/pac/1974/pdf/4003x0277.pdf Pristupljeno 5. prosinac 2020.

[9] "Genes". Boston University. Inačica izvorne stranice arhivirana 28. travanj 2020.. https://sphweb.bumc.bu.edu/otlt/MPH-Modules/PH/DNA-Genetics/DNA-Genetics3.html Pristupljeno 10. prosinac 2020.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[note 1]

[8]