Juniorski prvaci Hrvatske u nogometu za sezonu 1998./99. su bili nogometaši Varteksa iz Varaždina.
Prva liga
| mj | klub | it | pob | ner | por | gol+ | gol- | bod |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Varteks (Varaždin) | 22 | 18 | 2 | 2 | 70 | 22 | 56 |
| 2. | Hajduk (Split) | 22 | 12 | 7 | 3 | 47 | 22 | 43 |
| 3. | Croatia (Zagreb) | 22 | 13 | 4 | 5 | 42 | 21 | 43 |
| 4. | Osijek (Osijek) | 22 | 12 | 5 | 5 | 48 | 28 | 41 |
| 5. | Hrvatski Dragovoljac (Zagreb) | 22 | 12 | 4 | 6 | 52 | 30 | 40 |
| 6. | Zagreb (Zagreb) | 22 | 12 | 3 | 7 | 55 | 39 | 39 |
| 7. | Cibalia (Vinkovci) | 22 | 10 | 3 | 9 | 24 | 26 | 33 |
| 8. | Rijeka (Rijeka) | 22 | 8 | 2 | 12 | 26 | 33 | 26 |
| 9. | Zadarkomerc (Zadar) | 22 | 5 | 4 | 13 | 16 | 41 | 19 |
| 10. | Slaven Belupo (Koprivnica) | 22 | 3 | 4 | 15 | 22 | 60 | 13 |
| 11. | Šibenik (Šibenik) | 22 | 1 | 7 | 14 | 28 | 50 | 10 |
| 12. | Mladost 127 (Suhopolje) | 22 | 1 | 5 | 16 | 18 | 65 | 8 |
Izvori
- Kruno Sabolić: Hrvatski športski almanah 1999/2000, Zagreb, 2000.
Nedovršeni članak Prvenstvo Hrvatske u nogometu za juniore 1998./99. koji govori o nogometu treba dopuniti. Dopunite ga prema pravilima uređivanja Hrvatske internetske enciklopedije.