Mala jezgričina RNK
Mala jezgričina RNK (eng. small nucleolar RNA, snoRNK), vrsta nekodirajuće male RNK.[1] Postoji kod eukariota i nekih arheja. Primarno vode kemijske modifikacije inih RNK, uglavnom ribosomskih RNK, prijenosnih RNK i malih jezgrenih RNK. Dva su glavna razreda snoRNK:
- C/D box snoRNK, koji su združeni s metilacijom[2]
- H/ACA box snoRNK, koji su združeni s pseudoridilacijom.[2]
O snoRNK obično se govori kao RNK vodičima (guide RNA), ali ih se ne bi smjeli brkati s RNK vodičima koji upravljaju uređivanjem RNK u tripanosomima. SnoRNK igra ulogu u genomskom upisu.[3][4][5]
SnoRNK genski upućuju ne samo bjelančevine, nego i djeluju kao RNK vodiči, u kojem enzimi enzimi dovode RNK na pravo mjesto. U stanici leže snoRNK, kao skoro sve ostale RNK, ali ne ogoljene nego združene s bjelančevinama poput ribonukleoproteinima, pa se govori o snoRNP-ima (eng. small nucleolar ribonucleoprotein particle, mala jezgričina ribonukleoproteinska čestica).
Modifikacije koje se preko ovih snoRNP-a u ribosomskim RNK uvode esencijalni su za funkciju ribosoma kao dio translacije, i u snRNK esencijalni za izrezivanje (eng. splicing). SnoRNP, kao što ime implicira, može se većinom naći u staničnoj jezgrici (odatle ime jezgričina 0), gdje se modificiraju rRNK, a iznimku čine srodne scaRNK. SnoRNK se kod eukariota unose u staničnu jezgru putem Crm1.[6]
Pored mofikacija nukleinskih kiselina poduprtih putem RNK-vodiča, postoje izravne modifikacije bez pomoći ovih malih RNK, poput metiliranja DNK putem DNK-metiltransferaza, metiliranja 5' kapice ili uređivanje RNK primjerice putem enzima ADAR-a).
Izvori
- ↑ Derrien, T. et al.(2011): The Long Non-Coding RNAs: A New (P)layer in the "Dark Matter". In: Front Genet. 2:107. PMID 22303401 doi: 10.3389/fgene.2011.00107 PDF
- ↑ 2,0 2,1 "Eukaryotic ribosomal RNA: the recent excitement in the nucleotide modification problem". Chromosoma 105 (7–8): 391–400. lipnja 1997. doi:10.1007/BF02510475. PMID 9211966
- ↑ K. R. Phipps, J. Charette, S. J. Baserga: The small subunit processome in ribosome biogenesis?progress and prospects. In: Wiley interdisciplinary reviews. RNA. Band 2, Nummer 1, 2011 Jan-Feb, S. 1–21, DOI:10.1002/wrna.57 . PMID 21318072. PMC:3035417 .
- ↑ M. Girardot, J. Cavaillé, R. Feil: Small regulatory RNAs controlled by genomic imprinting and their contribution to human disease. In: Epigenetics : official journal of the DNA Methylation Society. Band 7, Nummer 12, Dezember 2012, S. 1341–1348, DOI:10.4161/epi.22884 . PMID 23154539. PMC:3528689 .
- ↑ M. S. Scott, M. Ono: From snoRNA to miRNA: Dual function regulatory non-coding RNAs. In: Biochimie. Band 93, Nummer 11, November 2011, S. 1987–1992, DOI:10.1016/j.biochi.2011.05.026 . PMID 21664409. PMC 3476530.
- ↑ C. Verheggen, E. Bertrand: CRM1 plays a nuclear role in transporting snoRNPs to nucleoli in higher eukaryotes. In: Nucleus (Austin, Tex.). Band 3, Nummer 2, März 2012, S. 132–137, DOI:10.4161/nucl.19266 . PMID 22555597. PMC:3383567 .