Nidovirales: razlika između inačica

Inačica od 2. siječanj 2022. u 19:03

SARS-CoV-2 pripada redu Nidovirales pod obitelj Coronaviridae.

Nidovirales je red virusa s životinjskim i ljudskim domaćinima. Red uključuje obitelji Coronaviridae^[1]^[2], Arteriviridae^[3],Roniviridae i Mesoniviridae.

Nidovirusi su jednolančani RNK virusi s pozitivnim osjećajem. Nazvani su latinskim Nidus, što znači gnijezdo, jer svi virusi ovog reda stvaraju 3 'ko-terminalni ugniježđen skup subgenomskih mRNK tijekom infekcije.

Virologija

Red Nidovirales sastoji se od virusa koji imaju jednolančane RNK genoma s pozitivnim osjećajem. Virusi pripadaju grupi IV baltimorskog klasifikacijskog sustava. Kao genomi pozitivnog smisla, virusi mogu koristiti neke proteinske stanice domaćina tijekom replikacije i ekspresije gena koji se događaju u citoplazmi stanice domaćina.

Genom

Ovaj redoslijed virusa može se razlikovati od ostalih RNK virusa po konstalaciji sedam sačuvanih domena - 5'-TM2-3CLpro-TM3-RdRp-Zm-HEL1-NendoU-3'- pri čemu su prva tri kodirana u ORF1a, a preostali četiri u ORF1b. TM2 i TM3 i transmembranske domene; RdRp je RNA polimeraza; Zm je domena vezanja Zn-klastera pripojena helikazom (HEL1); 3CLpro je 3C slična proteaza; a NendoU je endridukleaza specifična za uridilat. 3CLpro ima katalitičku dijagnozu His-Cys, a koristi se i kao glavna proteinaza koronavirusa SARS-a.

Taksonomija

Poredak Nidovirales može se podijeliti u dva sloja, ovisno o veličini genoma: oni s velikim genima (26,3–31,7 kilobaza) koji uključuju Coronaviridae i Roniviridae (veliki nidovirusi) i oni s malim genomima (mali nidovirusi) -a klada koja uključuje udaljeno srodne Arteriviridae (12,7–15,7 kb). Veliki nidovirusi kodiraju i 2'-O-metiltransferazu i 3'-5 'eksoribonukleazu (ExoN) - potonji su vrlo neuobičajeni za RNK virus. Oni također kodiraju superamiljenu 1 helikazu, specifičnu za uridilat endonukleazu (enzim jedinstven za nidoviruse) i nekoliko proteaza.

Vidi još

Izvori

PREUSMJERI Predložak:Izvori

↑ Luis Enjuanes, Isabel Sola, Sonia Zúñiga and Fernando Almazán (2008). "Coronavirus Replication and Interaction with Host". Unutar Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino. Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6
↑ Volker Thiel, ed. (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5
↑ Udeni B. R. Balasuriya and Eric J. Snijder (2008). "Arteriviruses". Unutar Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino. Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[sobrino4-1] Luis Enjuanes, Isabel Sola, Sonia Zúñiga and Fernando Almazán (2008). "Coronavirus Replication and Interaction with Host". Unutar Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino. Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[Thiel-2] Volker Thiel, ed. (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5

[sobrino3-3] Udeni B. R. Balasuriya and Eric J. Snijder (2008). "Arteriviruses". Unutar Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino. Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6

[1]

[2]

[3]

@@ Redak 1: / Redak 1: @@
 <!--'''Nidovirales'''-->[[File:SARS-CoV-2 virion animation.gif|thumb|left|400 px|[[SARS-CoV-2]] pripada redu Nidovirales pod obitelj [[Coronaviridae]].]]
-'''Nidovirales''' je red virusa s životinjskim i ljudskim domaćinima. Red uključuje obitelji [[Coronaviridae]]<ref name=sobrino4>{{cite book  |authors=Luis Enjuanes, Isabel Sola, Sonia Zúñiga and Fernando Almazán  |year=2008  |chapter=Coronavirus Replication and Interaction with Host  |editors=Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino  |title=Animal Viruses: Molecular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-22-6 }}</ref><ref name=Thiel>{{cite book  |editor=Volker Thiel  |year=2007  |title=Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-16-5 }}</ref>, [[Arteriviridae]]<ref name=sobrino3>{{cite book  |authors=Udeni B. R. Balasuriya and Eric J. Snijder  |year=2008  |chapter=Arteriviruses  |editor=Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino  |title=Animal Viruses: Molecular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-22-6 }}</ref>,[[Roniviridae]] i [[Mesoniviridae]].
+'''Nidovirales''' je red virusa s životinjskim i ljudskim domaćinima. Red uključuje obitelji [[Coronaviridae]]<ref name=sobrino4>{{Citiranje knjige  |authors=Luis Enjuanes, Isabel Sola, Sonia Zúñiga and Fernando Almazán  |year=2008  |chapter=Coronavirus Replication and Interaction with Host  |editors=Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino  |title=Animal Viruses: Molecular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-22-6 }}</ref><ref name=Thiel>{{Citiranje knjige  |editor=Volker Thiel  |year=2007  |title=Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-16-5 }}</ref>, [[Arteriviridae]]<ref name=sobrino3>{{Citiranje knjige  |authors=Udeni B. R. Balasuriya and Eric J. Snijder  |year=2008  |chapter=Arteriviruses  |editor=Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino  |title=Animal Viruses: Molecular Biology  |publisher=Caister Academic Press  |isbn=978-1-904455-22-6 }}</ref>,[[Roniviridae]] i [[Mesoniviridae]].
 Nidovirusi su jednolančani [[RNK virus|RNK virusi]] s pozitivnim osjećajem. Nazvani su [[Latinski|latinskim]] ''Nidus'', što znači gnijezdo, jer svi virusi ovog reda stvaraju 3 'ko-terminalni ugniježđen skup subgenomskih mRNK tijekom infekcije.