Mala jezgričina RNK: razlika između inačica

Izvor: Hrvatska internetska enciklopedija
Prijeđi na navigaciju Prijeđi na pretraživanje
Bot: Automatski unos stranica
 
m bnz
 
Redak 1: Redak 1:
<!--'''Mala jezgričina RNK'''-->'''Mala jezgričina RNK''' (eng. ''small nucleolar RNA'', snoRNK), vrsta [[Nekodirajuća RNK|nekodirajuće]] [[mala RNK|male RNK]].<ref>Derrien, T. ''et al.''(2011): ''The Long Non-Coding RNAs: A New (P)layer in the "Dark Matter".'' In: ''Front Genet.'' 2:107. PMID 22303401 doi: [http://dx.doi.org/10.3389%2Ffgene.2011.00107 10.3389/fgene.2011.00107] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3266617/pdf/fgene-02-00107.pdf PDF]</ref> Postoji kod [[eukarioti|eukariota]] i nekih [[arheje|arheja]]. Primarno vode kemijske modifikacije inih RNK, uglavnom [[ribosomska RNK|ribosomskih RNK]], [[prijenosna RNK|prijenosnih RNK]] i [[mala jezgrena RNK|malih jezgrenih RNK]]. Dva su glavna razreda snoRNK:
Mala jezgričina RNK''' (eng. ''small nucleolar RNA'', snoRNK), vrsta [[Nekodirajuća RNK|nekodirajuće]] [[mala RNK|male RNK]].<ref>Derrien, T. ''et al.''(2011): ''The Long Non-Coding RNAs: A New (P)layer in the "Dark Matter".'' In: ''Front Genet.'' 2:107. PMID 22303401 doi: [http://dx.doi.org/10.3389%2Ffgene.2011.00107 10.3389/fgene.2011.00107] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3266617/pdf/fgene-02-00107.pdf PDF]</ref> Postoji kod [[eukarioti|eukariota]] i nekih [[arheje|arheja]]. Primarno vode kemijske modifikacije inih RNK, uglavnom [[ribosomska RNK|ribosomskih RNK]], [[prijenosna RNK|prijenosnih RNK]] i [[mala jezgrena RNK|malih jezgrenih RNK]]. Dva su glavna razreda snoRNK:
* ''C/D box snoRNK'', koji su združeni s [[metilacija|metilacijom]]<ref name="pmid9211966">{{cite journal | vauthors = Maden BE, Hughes JM | title = Eukaryotic ribosomal RNA: the recent excitement in the nucleotide modification problem | journal = Chromosoma | volume = 105 | issue = 7–8 | pages = 391–400 | date = June 1997 | pmid = 9211966 | doi = 10.1007/BF02510475 }}</ref>
* ''C/D box snoRNK'', koji su združeni s [[metilacija|metilacijom]]<ref name="pmid9211966">{{cite journal | vauthors = Maden BE, Hughes JM | title = Eukaryotic ribosomal RNA: the recent excitement in the nucleotide modification problem | journal = Chromosoma | volume = 105 | issue = 7–8 | pages = 391–400 | date = June 1997 | pmid = 9211966 | doi = 10.1007/BF02510475 }}</ref>
* ''H/ACA box snoRNK'', koji su združeni s [[pseudoridilacija|pseudoridilacijom]].<ref name="pmid9211966"/>
* ''H/ACA box snoRNK'', koji su združeni s [[pseudoridilacija|pseudoridilacijom]].<ref name="pmid9211966"/>

Posljednja izmjena od 23. ožujak 2022. u 12:14

Mala jezgričina RNK (eng. small nucleolar RNA, snoRNK), vrsta nekodirajuće male RNK.[1] Postoji kod eukariota i nekih arheja. Primarno vode kemijske modifikacije inih RNK, uglavnom ribosomskih RNK, prijenosnih RNK i malih jezgrenih RNK. Dva su glavna razreda snoRNK:

O snoRNK obično se govori kao RNK vodičima (guide RNA), ali ih se ne bi smjeli brkati s RNK vodičima koji upravljaju uređivanjem RNK u tripanosomima. SnoRNK igra ulogu u genomskom upisu.[3][4][5]

SnoRNK genski upućuju ne samo bjelančevine, nego i djeluju kao RNK vodiči, u kojem enzimi enzimi dovode RNK na pravo mjesto. U stanici leže snoRNK, kao skoro sve ostale RNK, ali ne ogoljene nego združene s bjelančevinama poput ribonukleoproteinima, pa se govori o snoRNP-ima (eng. small nucleolar ribonucleoprotein particle, mala jezgričina ribonukleoproteinska čestica).

Modifikacije koje se preko ovih snoRNP-a u ribosomskim RNK uvode esencijalni su za funkciju ribosoma kao dio translacije, i u snRNK esencijalni za izrezivanje (eng. splicing). SnoRNP, kao što ime implicira, može se većinom naći u staničnoj jezgrici (odatle ime jezgričina 0), gdje se modificiraju rRNK, a iznimku čine srodne scaRNK. SnoRNK se kod eukariota unose u staničnu jezgru putem Crm1.[6]

Pored mofikacija nukleinskih kiselina poduprtih putem RNK-vodiča, postoje izravne modifikacije bez pomoći ovih malih RNK, poput metiliranja DNK putem DNK-metiltransferaza, metiliranja 5' kapice ili uređivanje RNK primjerice putem enzima ADAR-a).

Izvori[uredi]

  1. Derrien, T. et al.(2011): The Long Non-Coding RNAs: A New (P)layer in the "Dark Matter". In: Front Genet. 2:107. PMID 22303401 doi: 10.3389/fgene.2011.00107 PDF
  2. 2,0 2,1 "Eukaryotic ribosomal RNA: the recent excitement in the nucleotide modification problem". Chromosoma 105 (7–8): 391–400. lipanj 1997. doi:10.1007/BF02510475. PMID 9211966 
  3. K. R. Phipps, J. Charette, S. J. Baserga: The small subunit processome in ribosome biogenesis?progress and prospects. In: Wiley interdisciplinary reviews. RNA. Band 2, Nummer 1, 2011 Jan-Feb, S. 1–21, DOI:10.1002/wrna.57 . PMID 21318072. PMC:3035417 .
  4. M. Girardot, J. Cavaillé, R. Feil: Small regulatory RNAs controlled by genomic imprinting and their contribution to human disease. In: Epigenetics : official journal of the DNA Methylation Society. Band 7, Nummer 12, Dezember 2012, S. 1341–1348, DOI:10.4161/epi.22884 . PMID 23154539. PMC:3528689 .
  5. M. S. Scott, M. Ono: From snoRNA to miRNA: Dual function regulatory non-coding RNAs. In: Biochimie. Band 93, Nummer 11, November 2011, S. 1987–1992, DOI:10.1016/j.biochi.2011.05.026 . PMID 21664409. PMC 3476530.
  6. C. Verheggen, E. Bertrand: CRM1 plays a nuclear role in transporting snoRNPs to nucleoli in higher eukaryotes. In: Nucleus (Austin, Tex.). Band 3, Nummer 2, März 2012, S. 132–137, DOI:10.4161/nucl.19266 . PMID 22555597. PMC:3383567 .