Bazni par: razlika između inačica

Posljednja izmjena od 9. prosinac 2024. u 12:49

Bazni par (bp)' je jedinica koja se sastoji od dvije nukleobaze povezane međusobno vodikovim vezama. Oni čine građevne blokove dvostruke spirale DNK i doprinose presavijenoj strukturi i DNK i RNK. Diktirani specifičnim uzorcima vezanja vodika, Watson-Crickovi osnovni parovi (guanin-citozin i adenin-timin) omogućuju DNK spirali održavanje pravilne spiralne strukture koja suptilno ovisi o nukleotidnoj sekvenci.^[1] Komplementarna priroda ove strukture temeljene na parovima osigurava suvišnu kopiju genetskih informacija kodiranih u svakom lancu DNK. Redovita struktura i redundiranost podataka koje pruža DNK dvostruka spirala čine DNK pogodnim za pohranu genetskih informacija, dok spajanje baza između DNK i ulaznih nukleotida omogućava mehanizam putem kojeg DNK polimeraza replicira DNK, a RNK polimeraza prepisuje DNK u RNK. Mnogi proteini koji se vežu na DNK mogu prepoznati specifične obrasce uparivanja baza koji identificiraju određene regulatorne regije gena.

Primjeri

Slijedeće DNK sekvence ilustriraju dvostruke nizove. Prema dogovoru, gornji pramen se piše od kraja 5 'do kraja 3'; na taj način se na donjem lancu piše 3 'do 5'.

Slijed DNK u bazi:

        *ATCGATTGAGCTCTAGCG
        *TAGCTAACTCGAGATCGC

Odgovarajuća RNK sekvenca, u kojoj je uracil supstituiran timinom u lancu RNK:

        *AUCGAUUGAGCUCUAGCG
        *UAGCUAACUCGAGAUCGC

Prefiksi

    *bp = osnovni par (i) - jedan bp odgovara približno 3,4 A (340 pm)^[2] duljine duž niti, i otprilike 618 ili 643 daltona za DNK i RNK.
    *kb (= kbp) = kilo baznih parova = 1.000 bp
    *Mb (= Mbp) = mega bazni parovi = 1,000,000 bp
    *Gb = parovi osnovnih giga = 1.000.000.000 bp.

Izvori

↑ Sequence-Dependent Variability of B-DNA. 2005. str. 18–34. doi:10.1007/0-387-29148-2_2. ISBN 978-0-387-25579-8
↑ Molecular Biology of the Cell (6th ed.). New York/Abingdon: Garland Science, Taylor & Francis Group. prosinac 2014. str. 177. ISBN 978-0-8153-4432-2

Literatura

Molecular Biology of the Gene (5th ed.). Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press. 2004 (See esp. ch. 6 and 9)
Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. Springer. 2012. doi:10.1007/978-94-007-2172-2. ISBN 978-9-4007-2171-5
"Chapter 10. Alternative DNA Base-Pairing through Metal Coordination". Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. 2012. str. 269–294. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_10. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210343
"Chapter 11. Metal-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids with Purine and Pyrimidine-Derived Neucleosides". Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. 2012. str. 295–317. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_11. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210344

[1] Sequence-Dependent Variability of B-DNA. 2005. str. 18–34. doi:10.1007/0-387-29148-2_2. ISBN 978-0-387-25579-8

[2] Molecular Biology of the Cell (6th ed.). New York/Abingdon: Garland Science, Taylor & Francis Group. prosinac 2014. str. 177. ISBN 978-0-8153-4432-2

[1]

[2]

@@ Redak 1: / Redak 1: @@
-<!--'''Bazni par'''-->'''Bazni par (bp)''' je jedinica koja se sastoji od dvije nukleobaze povezane međusobno [[Vodik|vodikovim vezama]]. Oni čine građevne blokove dvostruke spirale DNK i doprinose presavijenoj strukturi i [[DNK]] i [[RNK]]. Diktirani specifičnim uzorcima vezanja vodika, Watson-Crickovi osnovni parovi ([[Guanin|guanin]]-[[Citozin|citozin]] i [[Adenin|adenin]]-[[Timin|timin]]) omogućuju DNK spirali održavanje pravilne spiralne strukture koja suptilno ovisi o [[Nukleotidna sekvenca|nukleotidnoj sekvenci]].<ref>{{Cite book |title=Sequence-Dependent Variability of B-DNA | doi=10.1007/0-387-29148-2_2 | journal=DNA Conformation and Transcription |pages=18–34 |year=2005 | vauthors = Zhurkin VB, Tolstorukov MY, Xu F, Colasanti AV, Olson WK  | isbn=978-0-387-25579-8 }}</ref>  Komplementarna priroda ove strukture temeljene na parovima osigurava suvišnu kopiju genetskih informacija kodiranih u svakom lancu DNK. Redovita struktura i redundiranost podataka koje pruža DNK dvostruka spirala čine DNK pogodnim za pohranu genetskih informacija, dok spajanje baza između DNK i ulaznih nukleotida omogućava mehanizam putem kojeg [[DNK polimeraza]] replicira DNK, a [[RNK polimeraza]] prepisuje DNK u RNK. Mnogi [[Protein|proteini]] koji se vežu na DNK mogu prepoznati specifične obrasce uparivanja baza koji identificiraju određene regulatorne regije gena.
+''Bazni par (bp)''' je jedinica koja se sastoji od dvije nukleobaze povezane međusobno [[Vodik|vodikovim vezama]]. Oni čine građevne blokove dvostruke spirale DNK i doprinose presavijenoj strukturi i [[DNK]] i [[RNK]]. Diktirani specifičnim uzorcima vezanja vodika, Watson-Crickovi osnovni parovi ([[Guanin|guanin]]-[[Citozin|citozin]] i [[Adenin|adenin]]-[[Timin|timin]]) omogućuju DNK spirali održavanje pravilne spiralne strukture koja suptilno ovisi o [[Nukleotidna sekvenca|nukleotidnoj sekvenci]].<ref>{{Citiranje knjige |title=Sequence-Dependent Variability of B-DNA | doi=10.1007/0-387-29148-2_2 | journal=DNA Conformation and Transcription |pages=18–34 |year=2005 | vauthors = Zhurkin VB, Tolstorukov MY, Xu F, Colasanti AV, Olson WK  | isbn=978-0-387-25579-8 }}</ref>  Komplementarna priroda ove strukture temeljene na parovima osigurava suvišnu kopiju genetskih informacija kodiranih u svakom lancu DNK. Redovita struktura i redundiranost podataka koje pruža DNK dvostruka spirala čine DNK pogodnim za pohranu genetskih informacija, dok spajanje baza između DNK i ulaznih nukleotida omogućava mehanizam putem kojeg [[DNK polimeraza]] replicira DNK, a [[RNK polimeraza]] prepisuje DNK u RNK. Mnogi [[Protein|proteini]] koji se vežu na DNK mogu prepoznati specifične obrasce uparivanja baza koji identificiraju određene regulatorne regije gena.
 == Primjeri ==
@@ Redak 16: / Redak 16: @@
 == Prefiksi ==
-      *bp = osnovni par (i) - jedan bp odgovara približno 3,4 [[Angstrom|A]] (340 [[Metar|pm]])<ref>{{cite book| vauthors = Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P |title=Molecular Biology of the Cell|date=December 2014|publisher=Garland Science, Taylor & Francis Group|location=New York/Abingdon|isbn=978-0-8153-4432-2|page=177|edition=6th|ref=alberts_mboc}}</ref> duljine duž niti, i otprilike 618 ili 643 [[Ujedinjena atomska masa|daltona]] za DNK i RNK.
+      *bp = osnovni par (i) - jedan bp odgovara približno 3,4 [[Angstrom|A]] (340 [[Metar|pm]])<ref>{{Citiranje knjige| vauthors = Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P |title=Molecular Biology of the Cell|date=December 2014|publisher=Garland Science, Taylor & Francis Group|location=New York/Abingdon|isbn=978-0-8153-4432-2|page=177|edition=6th|ref=alberts_mboc}}</ref> duljine duž niti, i otprilike 618 ili 643 [[Ujedinjena atomska masa|daltona]] za DNK i RNK.
       *kb (= kbp) = kilo baznih parova = 1.000 bp
       *Mb (= Mbp) = mega bazni parovi = 1,000,000 bp
@@ Redak 26: / Redak 26: @@
 == Literatura ==
 {{refbegin}}
-* {{cite book | vauthors = Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R |date=2004 |title=Molecular Biology of the Gene |edition=5th |publisher=Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press}} (See esp. ch. 6 and 9)
+* {{Citiranje knjige | vauthors = Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R |date=2004 |title=Molecular Biology of the Gene |edition=5th |publisher=Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press}} (See esp. ch. 6 and 9)
-* {{cite book | veditors = Sigel A, Sigel H, Sigel RK |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids|series=Metal Ions in Life Sciences |volume=10 |date=2012 |publisher=Springer |doi=10.1007/978-94-007-2172-2 |isbn=978-9-4007-2171-5}}
+* {{Citiranje knjige | veditors = Sigel A, Sigel H, Sigel RK |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids|series=Metal Ions in Life Sciences |volume=10 |date=2012 |publisher=Springer |doi=10.1007/978-94-007-2172-2 |isbn=978-9-4007-2171-5}}
-* {{cite book | vauthors = Clever GH, Shionoya M |doi=10.1007/978-94-007-2172-2_10 |pmid=22210343 |pages=269–294 |chapter=Chapter 10. Alternative DNA Base-Pairing through Metal Coordination |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids |volume=10 |date=2012 |series=Metal Ions in Life Sciences |isbn=978-94-007-2171-5 }}
+* {{Citiranje knjige | vauthors = Clever GH, Shionoya M |doi=10.1007/978-94-007-2172-2_10 |pmid=22210343 |pages=269–294 |chapter=Chapter 10. Alternative DNA Base-Pairing through Metal Coordination |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids |volume=10 |date=2012 |series=Metal Ions in Life Sciences |isbn=978-94-007-2171-5 }}
-* {{cite book | vauthors = Megger DA, Megger N, Mueller J |doi=10.1007/978-94-007-2172-2_11 |pmid=22210344 |pages=295–317 |chapter=Chapter 11. Metal-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids with Purine and Pyrimidine-Derived Neucleosides |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids |volume=10 |date=2012 |series=Metal Ions in Life Sciences |isbn=978-94-007-2171-5 }}
+* {{Citiranje knjige | vauthors = Megger DA, Megger N, Mueller J |doi=10.1007/978-94-007-2172-2_11 |pmid=22210344 |pages=295–317 |chapter=Chapter 11. Metal-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids with Purine and Pyrimidine-Derived Neucleosides |title=Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids |volume=10 |date=2012 |series=Metal Ions in Life Sciences |isbn=978-94-007-2171-5 }}
 {{refend}}
 [[Kategorija:Genetika]]